El método dideoxi de secuenciación, ideado por , se basa en la .

Como se utiliza una versión de ADN.

Como para iniciar la síntesis de ADN, se utiliza un corto complementario.

El elemento clave consiste en la introducción de didesoxinucleótidos (), que son nucleótidos que contienen la , de modo que el de la posición está sustituido por un .

Al carecer de uno de los grupos , cuando uno de estos nucleótidos se incorpora a una en , está cadena no puede continuar elongándose ya que el necesita un extremo para añadir el siguiente .

Por lo tanto, la incorporación de un implica la de la cadena.